Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms