Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pola1P33609 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola1P33609 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms