Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nedd1P33215 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms