Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Saa4P31532 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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