Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa2P31245 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms