Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnnd1P30999 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnnd1P30999 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms