Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msr1P30204 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msr1P30204 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms