Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc1P29341 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pabpc1P29341 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms