Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RxraP28700 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RxraP28700 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RxraP28700 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RxraP28700 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RxraP28700 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RxraP28700 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms