Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Marcksl1P28667 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Marcksl1P28667 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms