Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms