Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb3P28231 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb3P28231 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms