Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb1P28230 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb1P28230 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms