Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CebpbP28033 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CebpbP28033 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CebpbP28033 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms