Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav1P27870 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vav1P27870 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms