Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpbP27790 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms