Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfraP26618 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfraP26618 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms