Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2af2P26369 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2af2P26369 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms