Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna1P26231 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna1P26231 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms