Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tln1P26039 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms