Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nfkb1P25799 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms