Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf1bP25119 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf1bP25119 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms