Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd247P24161 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms