Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd8P23463 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms