Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms