Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkchP23298 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkchP23298 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkchP23298 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkchP23298 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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