Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx3P23198 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms