Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd3eP22646 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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