Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb9P20615 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms