Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TP20293 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TP20293 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TP20293 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TP20293 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TP20293 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TP20293 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TP20293 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TP20293 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TP20293 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TP20293 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP20293 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms