Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P20040 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P20040 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P20040 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P20040 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P20040 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P20040 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms