Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms