Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18524 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18524 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18524 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18524 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18524 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18524 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18524 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18524 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18524 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18524 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18524 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms