Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Selenbp1P17563 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Selenbp1P17563 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms