Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms