Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkceP16054 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkceP16054 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms