Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms