Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Timp1P12032 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp1P12032 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms