Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtprqP0C5E4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprqP0C5E4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprqP0C5E4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprqP0C5E4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms