Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeflP08551 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeflP08551 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NeflP08551 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeflP08551 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeflP08551 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeflP08551 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeflP08551 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeflP08551 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeflP08551 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms