Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spta1P08032 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spta1P08032 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms