Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gap43P06837 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gap43P06837 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gap43P06837 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms