Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TnfP06804 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnfP06804 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnfP06804 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnfP06804 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnfP06804 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TnfP06804 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TnfP06804 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms