Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa4P06798 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms