Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06344 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06344 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06344 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06344 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06344 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06344 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms