Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06321 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06321 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P06321 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06321 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06321 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06321 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms