Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgamP05555 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgamP05555 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms