Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf3P05524 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf3P05524 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms