Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb1P04230 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms