Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01808 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01808 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01808 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01808 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01808 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01808 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01808 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms